因應跨領域和科學背景人才新需求，本系規劃應用技術為主和基礎理論為輔的彈性學制，培養具量子概念和高科技材料應用的人才，或提升基礎物理和天文應用知識的人才，希望藉由輔修制度提供外系同學一個多元跨域的學習管道，進而增加求職競爭力。
依「淡江大學跨領域專長課程實施要點」第7點「由各學系設置跨領域專長課程輔導教師，輔導修讀本系跨領域專長課程學生之選課規劃及課程學習歷程」，本系跨領域課程輔導教師聯絡資訊如下：
Q：設計「彈性學制」的目的為何？
A：培養學生面對未來的挑戰，擁有跨界的知識、多元專業學習、跨領域整合能力，引領學生勇敢探險，擁有面對問題、解決問題的能力和態度。
Q：推動「彈性學制」的配合措施為何？
A：由各系增加自由選修學分，提供彈性學習自主選課的機會；安排跨領域專長課程輔導教師，引領學習，提供跨域學生諮詢。
Q：何謂外系「輔修」？
A：修讀本系課程以外，非本系自訂至少20學分特定輔修課程模組。
Q：「輔修」學位證書的格式？
A： 規劃於完成物理學系的「輔修」課程模組後，學位證書上會註明:「輔修：物理」。
參考資料：「淡江大學跨領域專長課程實施要點」